Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Gm21972J3QN38 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Gm21972J3QN38 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Gm21972J3QN38 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Gm21972J3QN38 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Gm21972J3QN38 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Gm21972J3QN38 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Gm21972J3QN38 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Gm21972J3QN38 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Gm21972J3QN38 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Gm21972J3QN38 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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