Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Gm20918J3QN17 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Gm20918J3QN17 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm20918J3QN17 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm20918J3QN17 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm20918J3QN17 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm20918J3QN17 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm20918J3QN17 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm20918J3QN17 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm20918J3QN17 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm20918J3QN17 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Gm20918J3QN17 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Gm20918J3QN17 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Gm20918J3QN17 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Gm20918J3QN17 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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