Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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