Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem200cJ3QK46 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms