Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
7530416G11RikJ3QJX6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms