Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
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Cldn34c3J3QJW5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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