Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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