Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm20828J3KMI7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20828J3KMI7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm20828J3KMI7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm20828J3KMI7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm20828J3KMI7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm20828J3KMI7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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