Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms