Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3tc1G3X9F6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms