Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms