Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20517G3UVU6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms