Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ercc6F8VPZ5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ercc6F8VPZ5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ercc6F8VPZ5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ercc6F8VPZ5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ercc6F8VPZ5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Ercc6F8VPZ5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ercc6F8VPZ5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ercc6F8VPZ5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ercc6F8VPZ5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ercc6F8VPZ5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ercc6F8VPZ5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ercc6F8VPZ5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ercc6F8VPZ5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ercc6F8VPZ5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ercc6F8VPZ5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ercc6F8VPZ5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ercc6F8VPZ5 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ercc6F8VPZ5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ercc6F8VPZ5 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ercc6F8VPZ5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ercc6F8VPZ5 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ercc6F8VPZ5 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ercc6F8VPZ5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ercc6F8VPZ5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ercc6F8VPZ5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ercc6F8VPZ5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ercc6F8VPZ5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms