Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms