Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms