Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8247F6VRJ8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms