Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gm5861F6VCN9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gm5861F6VCN9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm5861F6VCN9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm5861F6VCN9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm5861F6VCN9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Gm5861F6VCN9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Gm5861F6VCN9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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