Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
BC067074F6RXI4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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