Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms