Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Urb2E9Q7L1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms