Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf169E9Q7F2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf169E9Q7F2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms