Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms