Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms