Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1P8

Irf2bp2, Interferon regulatory factor 2-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf2bp2E9Q1P8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Irf2bp2E9Q1P8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Irf2bp2E9Q1P8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Irf2bp2E9Q1P8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Irf2bp2E9Q1P8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Irf2bp2E9Q1P8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Irf2bp2E9Q1P8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irf2bp2E9Q1P8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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