Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms