Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gcom1E9PZ54 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms