Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms