Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc6D3YZP9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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