Protein–RNA interactions for Protein: D3YWX3

9230113P08Rik, RIKEN cDNA 9230113P08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230113P08RikD3YWX3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
9230113P08RikD3YWX3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms