Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms