Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm4950D3YUM8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm4950D3YUM8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm4950D3YUM8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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