Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Cttnbp2B9EJA2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms