Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms