Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114 ms