Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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