Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Apol7aB2RT54 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms