Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms