Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms