Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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H2-M5A7VMS3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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