Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skint4A7TZF3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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