Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms