Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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