Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms