Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Lcn6A2AJB9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Lcn6A2AJB9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Lcn6A2AJB9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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Lcn6A2AJB9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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