Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms