Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B694

Trav14-2, T cell receptor alpha variable 14-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav14-2A0A075B694 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Trav14-2A0A075B694 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trav14-2A0A075B694 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Trav14-2A0A075B694 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Trav14-2A0A075B694 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Trav14-2A0A075B694 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Trav14-2A0A075B694 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trav14-2A0A075B694 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trav14-2A0A075B694 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Trav14-2A0A075B694 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trav14-2A0A075B694 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Trav14-2A0A075B694 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Trav14-2A0A075B694 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Trav14-2A0A075B694 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Trav14-2A0A075B694 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trav14-2A0A075B694 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trav14-2A0A075B694 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trav14-2A0A075B694 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trav14-2A0A075B694 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trav14-2A0A075B694 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trav14-2A0A075B694 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trav14-2A0A075B694 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trav14-2A0A075B694 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trav14-2A0A075B694 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trav14-2A0A075B694 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trav14-2A0A075B694 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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