Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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