Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms