Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt27Q9Z320 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Krt27Q9Z320 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Krt27Q9Z320 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Krt27Q9Z320 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Krt27Q9Z320 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Krt27Q9Z320 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Krt27Q9Z320 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Krt27Q9Z320 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms