Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms